Los costes de este sistema de abastecimiento son los más altos entre los diferentes sistemas de obtención de agua para consumo doméstico.
Con los precios medios del agua embotellada en el mercado, el coste de servirse de este sistema para beber y cocinar es de unos 600 euros al año, en una familia tipo de 4 habitantes. Naturalmente, es un dato medio. Si solo bebemos agua embotellada y cocinamos con agua del grifo, los datos cambian. Si utilizamos aguas embotelladas de alta calidad y precio, también se eleva el presupuesto bastante.
Los equipos de ósmosis inversa doméstica que podemos adquirir en el mercado oscilan entre los 90 euros de un equipo básico, como el Genius 4/75, y los 550 euros de los equipos de flujo directo más modernos. El mantenimiento anual también supone un coste, es necesario cambiar los filtros del equipo una vez al año y la membrana cada 4 aproximadamente. Podemos considerar unos 20 euros, si el mantenimiento nos lo realizamos nosotros mismos.
A la vista de todo esto, la instalación de un equipo de ósmosis inversa domestico supone un coste más bajo, comparado con el agua embotellada, aunque siempre será más barato beber del grifo sin ningún tratamiento, claramente.